Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC14.19□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.18□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
LRRTM2O43300 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
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