Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRAMEF22A3QJZ6 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRAMEF22A3QJZ6 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRAMEF22A3QJZ6 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRAMEF22A3QJZ6 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRAMEF22A3QJZ6 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRAMEF22A3QJZ6 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRAMEF22A3QJZ6 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRAMEF22A3QJZ6 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRAMEF22A3QJZ6 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRAMEF22A3QJZ6 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRAMEF22A3QJZ6 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRAMEF22A3QJZ6 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRAMEF22A3QJZ6 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRAMEF22A3QJZ6 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PRAMEF22A3QJZ6 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRAMEF22A3QJZ6 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PRAMEF22A3QJZ6 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRAMEF22A3QJZ6 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRAMEF22A3QJZ6 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PRAMEF22A3QJZ6 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRAMEF22A3QJZ6 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRAMEF22A3QJZ6 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRAMEF22A3QJZ6 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRAMEF22A3QJZ6 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRAMEF22A3QJZ6 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRAMEF22A3QJZ6 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PRAMEF22A3QJZ6 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRAMEF22A3QJZ6 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRAMEF22A3QJZ6 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRAMEF22A3QJZ6 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRAMEF22A3QJZ6 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRAMEF22A3QJZ6 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRAMEF22A3QJZ6 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRAMEF22A3QJZ6 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRAMEF22A3QJZ6 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRAMEF22A3QJZ6 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRAMEF22A3QJZ6 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRAMEF22A3QJZ6 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRAMEF22A3QJZ6 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRAMEF22A3QJZ6 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRAMEF22A3QJZ6 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRAMEF22A3QJZ6 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRAMEF22A3QJZ6 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRAMEF22A3QJZ6 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRAMEF22A3QJZ6 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRAMEF22A3QJZ6 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRAMEF22A3QJZ6 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRAMEF22A3QJZ6 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRAMEF22A3QJZ6 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRAMEF22A3QJZ6 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRAMEF22A3QJZ6 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRAMEF22A3QJZ6 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PRAMEF22A3QJZ6 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PRAMEF22A3QJZ6 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRAMEF22A3QJZ6 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRAMEF22A3QJZ6 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRAMEF22A3QJZ6 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRAMEF22A3QJZ6 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRAMEF22A3QJZ6 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PRAMEF22A3QJZ6 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRAMEF22A3QJZ6 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRAMEF22A3QJZ6 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRAMEF22A3QJZ6 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRAMEF22A3QJZ6 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRAMEF22A3QJZ6 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRAMEF22A3QJZ6 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRAMEF22A3QJZ6 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRAMEF22A3QJZ6 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRAMEF22A3QJZ6 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRAMEF22A3QJZ6 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRAMEF22A3QJZ6 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRAMEF22A3QJZ6 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PRAMEF22A3QJZ6 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PRAMEF22A3QJZ6 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PRAMEF22A3QJZ6 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PRAMEF22A3QJZ6 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PRAMEF22A3QJZ6 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PRAMEF22A3QJZ6 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PRAMEF22A3QJZ6 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PRAMEF22A3QJZ6 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PRAMEF22A3QJZ6 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PRAMEF22A3QJZ6 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PRAMEF22A3QJZ6 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PRAMEF22A3QJZ6 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PRAMEF22A3QJZ6 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PRAMEF22A3QJZ6 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PRAMEF22A3QJZ6 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PRAMEF22A3QJZ6 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PRAMEF22A3QJZ6 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PRAMEF22A3QJZ6 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PRAMEF22A3QJZ6 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PRAMEF22A3QJZ6 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PRAMEF22A3QJZ6 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms