Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K7

KDM2A, Lysine-specific demethylase 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM2AQ9Y2K7 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KDM2AQ9Y2K7 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KDM2AQ9Y2K7 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KDM2AQ9Y2K7 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
KDM2AQ9Y2K7 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KDM2AQ9Y2K7 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KDM2AQ9Y2K7 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KDM2AQ9Y2K7 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KDM2AQ9Y2K7 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KDM2AQ9Y2K7 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KDM2AQ9Y2K7 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KDM2AQ9Y2K7 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
KDM2AQ9Y2K7 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KDM2AQ9Y2K7 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KDM2AQ9Y2K7 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KDM2AQ9Y2K7 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KDM2AQ9Y2K7 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KDM2AQ9Y2K7 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KDM2AQ9Y2K7 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KDM2AQ9Y2K7 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KDM2AQ9Y2K7 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KDM2AQ9Y2K7 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KDM2AQ9Y2K7 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KDM2AQ9Y2K7 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KDM2AQ9Y2K7 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KDM2AQ9Y2K7 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KDM2AQ9Y2K7 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
KDM2AQ9Y2K7 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KDM2AQ9Y2K7 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KDM2AQ9Y2K7 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KDM2AQ9Y2K7 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KDM2AQ9Y2K7 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KDM2AQ9Y2K7 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KDM2AQ9Y2K7 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KDM2AQ9Y2K7 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KDM2AQ9Y2K7 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KDM2AQ9Y2K7 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KDM2AQ9Y2K7 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KDM2AQ9Y2K7 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KDM2AQ9Y2K7 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KDM2AQ9Y2K7 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KDM2AQ9Y2K7 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KDM2AQ9Y2K7 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KDM2AQ9Y2K7 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KDM2AQ9Y2K7 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KDM2AQ9Y2K7 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
KDM2AQ9Y2K7 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KDM2AQ9Y2K7 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KDM2AQ9Y2K7 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KDM2AQ9Y2K7 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KDM2AQ9Y2K7 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KDM2AQ9Y2K7 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KDM2AQ9Y2K7 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
KDM2AQ9Y2K7 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KDM2AQ9Y2K7 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KDM2AQ9Y2K7 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KDM2AQ9Y2K7 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KDM2AQ9Y2K7 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KDM2AQ9Y2K7 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KDM2AQ9Y2K7 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KDM2AQ9Y2K7 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KDM2AQ9Y2K7 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KDM2AQ9Y2K7 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KDM2AQ9Y2K7 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KDM2AQ9Y2K7 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KDM2AQ9Y2K7 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KDM2AQ9Y2K7 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KDM2AQ9Y2K7 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KDM2AQ9Y2K7 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KDM2AQ9Y2K7 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KDM2AQ9Y2K7 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KDM2AQ9Y2K7 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KDM2AQ9Y2K7 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KDM2AQ9Y2K7 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KDM2AQ9Y2K7 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KDM2AQ9Y2K7 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
KDM2AQ9Y2K7 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KDM2AQ9Y2K7 AC124312.2-201ENST00000546615 427 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KDM2AQ9Y2K7 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KDM2AQ9Y2K7 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KDM2AQ9Y2K7 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KDM2AQ9Y2K7 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KDM2AQ9Y2K7 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KDM2AQ9Y2K7 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KDM2AQ9Y2K7 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
KDM2AQ9Y2K7 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KDM2AQ9Y2K7 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KDM2AQ9Y2K7 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KDM2AQ9Y2K7 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KDM2AQ9Y2K7 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KDM2AQ9Y2K7 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KDM2AQ9Y2K7 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KDM2AQ9Y2K7 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KDM2AQ9Y2K7 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KDM2AQ9Y2K7 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KDM2AQ9Y2K7 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KDM2AQ9Y2K7 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KDM2AQ9Y2K7 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KDM2AQ9Y2K7 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KDM2AQ9Y2K7 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms