Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU6

FAM8A1, Protein FAM8A1, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM8A1Q9UBU6 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
FAM8A1Q9UBU6 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM8A1Q9UBU6 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM8A1Q9UBU6 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM8A1Q9UBU6 ADGRL1-201ENST00000340736 7853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM8A1Q9UBU6 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM8A1Q9UBU6 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM8A1Q9UBU6 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM8A1Q9UBU6 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM8A1Q9UBU6 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM8A1Q9UBU6 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM8A1Q9UBU6 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM8A1Q9UBU6 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM8A1Q9UBU6 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM8A1Q9UBU6 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM8A1Q9UBU6 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM8A1Q9UBU6 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM8A1Q9UBU6 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM8A1Q9UBU6 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM8A1Q9UBU6 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM8A1Q9UBU6 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM8A1Q9UBU6 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM8A1Q9UBU6 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM8A1Q9UBU6 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM8A1Q9UBU6 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM8A1Q9UBU6 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM8A1Q9UBU6 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM8A1Q9UBU6 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM8A1Q9UBU6 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM8A1Q9UBU6 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM8A1Q9UBU6 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM8A1Q9UBU6 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM8A1Q9UBU6 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM8A1Q9UBU6 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM8A1Q9UBU6 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM8A1Q9UBU6 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM8A1Q9UBU6 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM8A1Q9UBU6 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM8A1Q9UBU6 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.08■□□□□ 0
FAM8A1Q9UBU6 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM8A1Q9UBU6 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM8A1Q9UBU6 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM8A1Q9UBU6 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM8A1Q9UBU6 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM8A1Q9UBU6 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM8A1Q9UBU6 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM8A1Q9UBU6 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM8A1Q9UBU6 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM8A1Q9UBU6 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM8A1Q9UBU6 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM8A1Q9UBU6 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM8A1Q9UBU6 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM8A1Q9UBU6 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM8A1Q9UBU6 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM8A1Q9UBU6 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM8A1Q9UBU6 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM8A1Q9UBU6 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM8A1Q9UBU6 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM8A1Q9UBU6 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM8A1Q9UBU6 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM8A1Q9UBU6 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM8A1Q9UBU6 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM8A1Q9UBU6 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM8A1Q9UBU6 SLIT3-206ENST00000519560 9706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM8A1Q9UBU6 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM8A1Q9UBU6 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM8A1Q9UBU6 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM8A1Q9UBU6 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM8A1Q9UBU6 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM8A1Q9UBU6 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM8A1Q9UBU6 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM8A1Q9UBU6 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM8A1Q9UBU6 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM8A1Q9UBU6 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM8A1Q9UBU6 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM8A1Q9UBU6 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM8A1Q9UBU6 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM8A1Q9UBU6 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM8A1Q9UBU6 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM8A1Q9UBU6 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM8A1Q9UBU6 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM8A1Q9UBU6 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.07■□□□□ 0
FAM8A1Q9UBU6 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.07■□□□□ 0
FAM8A1Q9UBU6 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM8A1Q9UBU6 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.07■□□□□ 0
FAM8A1Q9UBU6 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM8A1Q9UBU6 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.07■□□□□ 0
FAM8A1Q9UBU6 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM8A1Q9UBU6 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM8A1Q9UBU6 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM8A1Q9UBU6 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM8A1Q9UBU6 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM8A1Q9UBU6 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM8A1Q9UBU6 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms