Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N2

ARHGAP28, Rho GTPase-activating protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP28Q9P2N2 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARHGAP28Q9P2N2 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARHGAP28Q9P2N2 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARHGAP28Q9P2N2 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARHGAP28Q9P2N2 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARHGAP28Q9P2N2 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARHGAP28Q9P2N2 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARHGAP28Q9P2N2 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARHGAP28Q9P2N2 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARHGAP28Q9P2N2 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARHGAP28Q9P2N2 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARHGAP28Q9P2N2 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARHGAP28Q9P2N2 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARHGAP28Q9P2N2 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARHGAP28Q9P2N2 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARHGAP28Q9P2N2 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARHGAP28Q9P2N2 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARHGAP28Q9P2N2 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARHGAP28Q9P2N2 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARHGAP28Q9P2N2 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARHGAP28Q9P2N2 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARHGAP28Q9P2N2 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARHGAP28Q9P2N2 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARHGAP28Q9P2N2 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARHGAP28Q9P2N2 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARHGAP28Q9P2N2 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARHGAP28Q9P2N2 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARHGAP28Q9P2N2 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARHGAP28Q9P2N2 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARHGAP28Q9P2N2 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARHGAP28Q9P2N2 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARHGAP28Q9P2N2 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARHGAP28Q9P2N2 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARHGAP28Q9P2N2 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARHGAP28Q9P2N2 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARHGAP28Q9P2N2 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARHGAP28Q9P2N2 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARHGAP28Q9P2N2 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARHGAP28Q9P2N2 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARHGAP28Q9P2N2 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARHGAP28Q9P2N2 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARHGAP28Q9P2N2 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARHGAP28Q9P2N2 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARHGAP28Q9P2N2 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ARHGAP28Q9P2N2 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARHGAP28Q9P2N2 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ARHGAP28Q9P2N2 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ARHGAP28Q9P2N2 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ARHGAP28Q9P2N2 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ARHGAP28Q9P2N2 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARHGAP28Q9P2N2 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARHGAP28Q9P2N2 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARHGAP28Q9P2N2 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARHGAP28Q9P2N2 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARHGAP28Q9P2N2 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARHGAP28Q9P2N2 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARHGAP28Q9P2N2 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARHGAP28Q9P2N2 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARHGAP28Q9P2N2 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARHGAP28Q9P2N2 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARHGAP28Q9P2N2 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARHGAP28Q9P2N2 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARHGAP28Q9P2N2 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARHGAP28Q9P2N2 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARHGAP28Q9P2N2 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARHGAP28Q9P2N2 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARHGAP28Q9P2N2 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARHGAP28Q9P2N2 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARHGAP28Q9P2N2 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARHGAP28Q9P2N2 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARHGAP28Q9P2N2 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ARHGAP28Q9P2N2 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARHGAP28Q9P2N2 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARHGAP28Q9P2N2 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARHGAP28Q9P2N2 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARHGAP28Q9P2N2 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARHGAP28Q9P2N2 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARHGAP28Q9P2N2 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARHGAP28Q9P2N2 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARHGAP28Q9P2N2 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARHGAP28Q9P2N2 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARHGAP28Q9P2N2 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARHGAP28Q9P2N2 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARHGAP28Q9P2N2 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARHGAP28Q9P2N2 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARHGAP28Q9P2N2 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARHGAP28Q9P2N2 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ARHGAP28Q9P2N2 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARHGAP28Q9P2N2 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARHGAP28Q9P2N2 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARHGAP28Q9P2N2 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARHGAP28Q9P2N2 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARHGAP28Q9P2N2 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARHGAP28Q9P2N2 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARHGAP28Q9P2N2 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARHGAP28Q9P2N2 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ARHGAP28Q9P2N2 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARHGAP28Q9P2N2 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARHGAP28Q9P2N2 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARHGAP28Q9P2N2 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms