Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 AC233724.19-201ENST00000639969 597 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCDC180Q9P1Z9 AC106774.5-201ENST00000640558 597 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCDC180Q9P1Z9 AC233724.18-201ENST00000640803 597 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCDC180Q9P1Z9 AC233724.21-201ENST00000640846 597 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCDC180Q9P1Z9 SERPINA1-209ENST00000449399 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCDC180Q9P1Z9 CRYM-202ENST00000543948 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CCDC180Q9P1Z9 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CCDC180Q9P1Z9 DHRS7-209ENST00000557185 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CCDC180Q9P1Z9 TMEM14C-201ENST00000229563 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CCDC180Q9P1Z9 IGHV5-51-201ENST00000390626 410 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CCDC180Q9P1Z9 AC103702.2-203ENST00000425510 379 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CCDC180Q9P1Z9 PSAT1P2-201ENST00000426107 972 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
CCDC180Q9P1Z9 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CCDC180Q9P1Z9 LINC00892-203ENST00000454385 686 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CCDC180Q9P1Z9 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CCDC180Q9P1Z9 AC087203.1-201ENST00000532111 1181 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
CCDC180Q9P1Z9 GOLGA2P7-209ENST00000560408 745 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
CCDC180Q9P1Z9 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CCDC180Q9P1Z9 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CCDC180Q9P1Z9 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CCDC180Q9P1Z9 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CCDC180Q9P1Z9 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CCDC180Q9P1Z9 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CCDC180Q9P1Z9 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CCDC180Q9P1Z9 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CCDC180Q9P1Z9 MSANTD2P1-201ENST00000445341 1368 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
CCDC180Q9P1Z9 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCDC180Q9P1Z9 PRELID3B-202ENST00000371033 943 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCDC180Q9P1Z9 HDAC8-204ENST00000373560 819 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCDC180Q9P1Z9 GRPEL2P1-201ENST00000453145 339 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
CCDC180Q9P1Z9 RORA-AS1-201ENST00000501579 761 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCDC180Q9P1Z9 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
CCDC180Q9P1Z9 IGHEP1-201ENST00000521393 651 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
CCDC180Q9P1Z9 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCDC180Q9P1Z9 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCDC180Q9P1Z9 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCDC180Q9P1Z9 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCDC180Q9P1Z9 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCDC180Q9P1Z9 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCDC180Q9P1Z9 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCDC180Q9P1Z9 RHOG-201ENST00000351018 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCDC180Q9P1Z9 NIFK-AS1-203ENST00000419902 1316 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCDC180Q9P1Z9 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCDC180Q9P1Z9 HIST1H4B-201ENST00000377745 438 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCDC180Q9P1Z9 SAT1-201ENST00000379251 801 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCDC180Q9P1Z9 SAT1-202ENST00000379253 909 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCDC180Q9P1Z9 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCDC180Q9P1Z9 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCDC180Q9P1Z9 AC073210.1-201ENST00000414799 232 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
CCDC180Q9P1Z9 AL590235.1-201ENST00000564650 861 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
CCDC180Q9P1Z9 POLR2E-204ENST00000586746 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCDC180Q9P1Z9 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCDC180Q9P1Z9 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCDC180Q9P1Z9 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
CCDC180Q9P1Z9 MRPL55-205ENST00000366731 1423 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCDC180Q9P1Z9 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCDC180Q9P1Z9 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCDC180Q9P1Z9 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
CCDC180Q9P1Z9 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCDC180Q9P1Z9 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCDC180Q9P1Z9 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCDC180Q9P1Z9 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
CCDC180Q9P1Z9 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCDC180Q9P1Z9 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCDC180Q9P1Z9 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCDC180Q9P1Z9 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCDC180Q9P1Z9 PLA2G2A-202ENST00000400520 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCDC180Q9P1Z9 OR52M2P-201ENST00000414298 959 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
CCDC180Q9P1Z9 AC011444.1-201ENST00000587836 639 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCDC180Q9P1Z9 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCDC180Q9P1Z9 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCDC180Q9P1Z9 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC180Q9P1Z9 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC180Q9P1Z9 KLK4-201ENST00000324041 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC180Q9P1Z9 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC180Q9P1Z9 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC180Q9P1Z9 PAIP2-201ENST00000265192 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC180Q9P1Z9 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC180Q9P1Z9 VCX3A-202ENST00000398729 808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC180Q9P1Z9 COLEC11-204ENST00000402794 1134 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC180Q9P1Z9 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC180Q9P1Z9 AC004895.1-203ENST00000428901 540 ntTSL 4 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC180Q9P1Z9 GNAT1-202ENST00000433068 1224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC180Q9P1Z9 AC092896.1-201ENST00000465850 380 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC180Q9P1Z9 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC180Q9P1Z9 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC180Q9P1Z9 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC180Q9P1Z9 HPX-213ENST00000615166 826 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC180Q9P1Z9 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC180Q9P1Z9 RPF1-201ENST00000370654 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC180Q9P1Z9 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC180Q9P1Z9 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC180Q9P1Z9 BIN3-202ENST00000399977 1340 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC180Q9P1Z9 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC180Q9P1Z9 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC180Q9P1Z9 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC180Q9P1Z9 EHF-208ENST00000530286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC180Q9P1Z9 AC079949.1-201ENST00000541419 505 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC180Q9P1Z9 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC180Q9P1Z9 KXD1-211ENST00000599319 707 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms