Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX08

COMMD8, COMM domain-containing protein 8, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD8Q9NX08 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
COMMD8Q9NX08 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
COMMD8Q9NX08 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
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