Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSP4

CENPM, Centromere protein M, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPMQ9NSP4 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CENPMQ9NSP4 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CENPMQ9NSP4 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CENPMQ9NSP4 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CENPMQ9NSP4 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CENPMQ9NSP4 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CENPMQ9NSP4 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CENPMQ9NSP4 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CENPMQ9NSP4 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CENPMQ9NSP4 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CENPMQ9NSP4 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CENPMQ9NSP4 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CENPMQ9NSP4 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CENPMQ9NSP4 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CENPMQ9NSP4 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CENPMQ9NSP4 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CENPMQ9NSP4 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CENPMQ9NSP4 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CENPMQ9NSP4 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CENPMQ9NSP4 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CENPMQ9NSP4 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CENPMQ9NSP4 NHSL1-202ENST00000343505 6535 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CENPMQ9NSP4 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CENPMQ9NSP4 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CENPMQ9NSP4 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CENPMQ9NSP4 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CENPMQ9NSP4 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CENPMQ9NSP4 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CENPMQ9NSP4 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CENPMQ9NSP4 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CENPMQ9NSP4 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CENPMQ9NSP4 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CENPMQ9NSP4 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CENPMQ9NSP4 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CENPMQ9NSP4 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CENPMQ9NSP4 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CENPMQ9NSP4 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CENPMQ9NSP4 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CENPMQ9NSP4 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CENPMQ9NSP4 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CENPMQ9NSP4 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CENPMQ9NSP4 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CENPMQ9NSP4 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CENPMQ9NSP4 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CENPMQ9NSP4 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CENPMQ9NSP4 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 TICRR-201ENST00000268138 6775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 GALNT4-201ENST00000529983 5399 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 AL356275.1-201ENST00000638446 7440 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 RIC1-203ENST00000414202 6774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 ADCYAP1R1-207ENST00000614107 6575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CENPMQ9NSP4 GNB1L-201ENST00000329517 6706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms