Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC14.31□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC14.3□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
BHLHE41Q9C0J9 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms