Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms