Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZC1

CELF4, CUGBP Elav-like family member 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF4Q9BZC1 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CELF4Q9BZC1 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CELF4Q9BZC1 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CELF4Q9BZC1 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CELF4Q9BZC1 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CELF4Q9BZC1 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CELF4Q9BZC1 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CELF4Q9BZC1 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CELF4Q9BZC1 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CELF4Q9BZC1 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CELF4Q9BZC1 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CELF4Q9BZC1 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CELF4Q9BZC1 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CELF4Q9BZC1 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CELF4Q9BZC1 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CELF4Q9BZC1 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CELF4Q9BZC1 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CELF4Q9BZC1 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CELF4Q9BZC1 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CELF4Q9BZC1 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CELF4Q9BZC1 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CELF4Q9BZC1 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CELF4Q9BZC1 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CELF4Q9BZC1 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CELF4Q9BZC1 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CELF4Q9BZC1 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CELF4Q9BZC1 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CELF4Q9BZC1 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CELF4Q9BZC1 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CELF4Q9BZC1 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CELF4Q9BZC1 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CELF4Q9BZC1 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CELF4Q9BZC1 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CELF4Q9BZC1 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CELF4Q9BZC1 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CELF4Q9BZC1 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CELF4Q9BZC1 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CELF4Q9BZC1 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CELF4Q9BZC1 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CELF4Q9BZC1 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CELF4Q9BZC1 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CELF4Q9BZC1 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CELF4Q9BZC1 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CELF4Q9BZC1 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CELF4Q9BZC1 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CELF4Q9BZC1 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CELF4Q9BZC1 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CELF4Q9BZC1 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CELF4Q9BZC1 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CELF4Q9BZC1 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CELF4Q9BZC1 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CELF4Q9BZC1 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CELF4Q9BZC1 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CELF4Q9BZC1 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CELF4Q9BZC1 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CELF4Q9BZC1 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CELF4Q9BZC1 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CELF4Q9BZC1 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CELF4Q9BZC1 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CELF4Q9BZC1 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CELF4Q9BZC1 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CELF4Q9BZC1 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CELF4Q9BZC1 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CELF4Q9BZC1 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CELF4Q9BZC1 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CELF4Q9BZC1 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CELF4Q9BZC1 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CELF4Q9BZC1 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
CELF4Q9BZC1 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CELF4Q9BZC1 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CELF4Q9BZC1 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CELF4Q9BZC1 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CELF4Q9BZC1 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CELF4Q9BZC1 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CELF4Q9BZC1 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CELF4Q9BZC1 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CELF4Q9BZC1 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CELF4Q9BZC1 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CELF4Q9BZC1 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CELF4Q9BZC1 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CELF4Q9BZC1 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CELF4Q9BZC1 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CELF4Q9BZC1 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CELF4Q9BZC1 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CELF4Q9BZC1 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CELF4Q9BZC1 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CELF4Q9BZC1 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CELF4Q9BZC1 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CELF4Q9BZC1 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CELF4Q9BZC1 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CELF4Q9BZC1 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CELF4Q9BZC1 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CELF4Q9BZC1 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CELF4Q9BZC1 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CELF4Q9BZC1 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CELF4Q9BZC1 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CELF4Q9BZC1 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CELF4Q9BZC1 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CELF4Q9BZC1 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CELF4Q9BZC1 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms