Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV7

BCO2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCO2Q9BYV7 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BCO2Q9BYV7 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BCO2Q9BYV7 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BCO2Q9BYV7 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BCO2Q9BYV7 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BCO2Q9BYV7 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BCO2Q9BYV7 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BCO2Q9BYV7 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
BCO2Q9BYV7 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BCO2Q9BYV7 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BCO2Q9BYV7 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BCO2Q9BYV7 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BCO2Q9BYV7 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BCO2Q9BYV7 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BCO2Q9BYV7 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BCO2Q9BYV7 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BCO2Q9BYV7 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BCO2Q9BYV7 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BCO2Q9BYV7 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BCO2Q9BYV7 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
BCO2Q9BYV7 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BCO2Q9BYV7 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BCO2Q9BYV7 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BCO2Q9BYV7 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BCO2Q9BYV7 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BCO2Q9BYV7 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BCO2Q9BYV7 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BCO2Q9BYV7 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BCO2Q9BYV7 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BCO2Q9BYV7 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BCO2Q9BYV7 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BCO2Q9BYV7 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BCO2Q9BYV7 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BCO2Q9BYV7 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BCO2Q9BYV7 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BCO2Q9BYV7 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BCO2Q9BYV7 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
BCO2Q9BYV7 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BCO2Q9BYV7 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BCO2Q9BYV7 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
BCO2Q9BYV7 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BCO2Q9BYV7 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BCO2Q9BYV7 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BCO2Q9BYV7 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BCO2Q9BYV7 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
BCO2Q9BYV7 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BCO2Q9BYV7 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BCO2Q9BYV7 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BCO2Q9BYV7 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BCO2Q9BYV7 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BCO2Q9BYV7 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BCO2Q9BYV7 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BCO2Q9BYV7 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BCO2Q9BYV7 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BCO2Q9BYV7 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BCO2Q9BYV7 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BCO2Q9BYV7 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BCO2Q9BYV7 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BCO2Q9BYV7 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BCO2Q9BYV7 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BCO2Q9BYV7 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BCO2Q9BYV7 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BCO2Q9BYV7 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BCO2Q9BYV7 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
BCO2Q9BYV7 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BCO2Q9BYV7 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BCO2Q9BYV7 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
BCO2Q9BYV7 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BCO2Q9BYV7 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BCO2Q9BYV7 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BCO2Q9BYV7 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BCO2Q9BYV7 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BCO2Q9BYV7 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BCO2Q9BYV7 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BCO2Q9BYV7 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
BCO2Q9BYV7 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BCO2Q9BYV7 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BCO2Q9BYV7 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BCO2Q9BYV7 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BCO2Q9BYV7 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BCO2Q9BYV7 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BCO2Q9BYV7 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BCO2Q9BYV7 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BCO2Q9BYV7 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BCO2Q9BYV7 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BCO2Q9BYV7 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BCO2Q9BYV7 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BCO2Q9BYV7 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BCO2Q9BYV7 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BCO2Q9BYV7 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BCO2Q9BYV7 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BCO2Q9BYV7 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BCO2Q9BYV7 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BCO2Q9BYV7 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BCO2Q9BYV7 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BCO2Q9BYV7 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BCO2Q9BYV7 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BCO2Q9BYV7 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BCO2Q9BYV7 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BCO2Q9BYV7 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms