Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYCP2Q9BX26 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYCP2Q9BX26 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYCP2Q9BX26 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYCP2Q9BX26 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYCP2Q9BX26 ZNF586-204ENST00000598183 603 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYCP2Q9BX26 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYCP2Q9BX26 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYCP2Q9BX26 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYCP2Q9BX26 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYCP2Q9BX26 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYCP2Q9BX26 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYCP2Q9BX26 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYCP2Q9BX26 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYCP2Q9BX26 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYCP2Q9BX26 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYCP2Q9BX26 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYCP2Q9BX26 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYCP2Q9BX26 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYCP2Q9BX26 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYCP2Q9BX26 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYCP2Q9BX26 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYCP2Q9BX26 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYCP2Q9BX26 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SYCP2Q9BX26 Metazoa_SRP.100-201ENST00000447610 282 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SYCP2Q9BX26 RN7SL396P-201ENST00000471086 295 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SYCP2Q9BX26 REEP5-205ENST00000504247 480 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYCP2Q9BX26 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYCP2Q9BX26 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SYCP2Q9BX26 DNAJB13-203ENST00000537753 912 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYCP2Q9BX26 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYCP2Q9BX26 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYCP2Q9BX26 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYCP2Q9BX26 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYCP2Q9BX26 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYCP2Q9BX26 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SYCP2Q9BX26 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYCP2Q9BX26 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYCP2Q9BX26 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYCP2Q9BX26 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYCP2Q9BX26 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYCP2Q9BX26 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYCP2Q9BX26 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYCP2Q9BX26 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYCP2Q9BX26 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYCP2Q9BX26 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYCP2Q9BX26 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYCP2Q9BX26 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYCP2Q9BX26 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYCP2Q9BX26 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYCP2Q9BX26 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYCP2Q9BX26 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYCP2Q9BX26 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYCP2Q9BX26 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYCP2Q9BX26 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYCP2Q9BX26 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYCP2Q9BX26 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYCP2Q9BX26 AC234644.1-201ENST00000406065 370 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SYCP2Q9BX26 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYCP2Q9BX26 IDS-203ENST00000428056 1213 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYCP2Q9BX26 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYCP2Q9BX26 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYCP2Q9BX26 AC012645.2-201ENST00000566190 553 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYCP2Q9BX26 AC005759.1-202ENST00000599416 415 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYCP2Q9BX26 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYCP2Q9BX26 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYCP2Q9BX26 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYCP2Q9BX26 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYCP2Q9BX26 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYCP2Q9BX26 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYCP2Q9BX26 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYCP2Q9BX26 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYCP2Q9BX26 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYCP2Q9BX26 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYCP2Q9BX26 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYCP2Q9BX26 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYCP2Q9BX26 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYCP2Q9BX26 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYCP2Q9BX26 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYCP2Q9BX26 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYCP2Q9BX26 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYCP2Q9BX26 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYCP2Q9BX26 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYCP2Q9BX26 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYCP2Q9BX26 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYCP2Q9BX26 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYCP2Q9BX26 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYCP2Q9BX26 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYCP2Q9BX26 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYCP2Q9BX26 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYCP2Q9BX26 AL390778.2-201ENST00000420883 886 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYCP2Q9BX26 PSMD4P1-201ENST00000433951 1109 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SYCP2Q9BX26 PPOX-204ENST00000462866 473 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYCP2Q9BX26 APOPT1-209ENST00000492189 513 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYCP2Q9BX26 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYCP2Q9BX26 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYCP2Q9BX26 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYCP2Q9BX26 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYCP2Q9BX26 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYCP2Q9BX26 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms