Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms