Protein–RNA interactions for Protein: Q96RT8

TUBGCP5, Gamma-tubulin complex component 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBGCP5Q96RT8 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBGCP5Q96RT8 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBGCP5Q96RT8 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBGCP5Q96RT8 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBGCP5Q96RT8 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBGCP5Q96RT8 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBGCP5Q96RT8 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBGCP5Q96RT8 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBGCP5Q96RT8 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBGCP5Q96RT8 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBGCP5Q96RT8 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBGCP5Q96RT8 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBGCP5Q96RT8 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBGCP5Q96RT8 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBGCP5Q96RT8 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBGCP5Q96RT8 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBGCP5Q96RT8 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBGCP5Q96RT8 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBGCP5Q96RT8 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBGCP5Q96RT8 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBGCP5Q96RT8 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBGCP5Q96RT8 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBGCP5Q96RT8 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBGCP5Q96RT8 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBGCP5Q96RT8 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBGCP5Q96RT8 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBGCP5Q96RT8 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TUBGCP5Q96RT8 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBGCP5Q96RT8 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBGCP5Q96RT8 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBGCP5Q96RT8 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBGCP5Q96RT8 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBGCP5Q96RT8 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBGCP5Q96RT8 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBGCP5Q96RT8 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBGCP5Q96RT8 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBGCP5Q96RT8 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBGCP5Q96RT8 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBGCP5Q96RT8 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBGCP5Q96RT8 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBGCP5Q96RT8 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBGCP5Q96RT8 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBGCP5Q96RT8 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBGCP5Q96RT8 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBGCP5Q96RT8 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBGCP5Q96RT8 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBGCP5Q96RT8 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBGCP5Q96RT8 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBGCP5Q96RT8 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBGCP5Q96RT8 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBGCP5Q96RT8 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBGCP5Q96RT8 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBGCP5Q96RT8 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBGCP5Q96RT8 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBGCP5Q96RT8 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBGCP5Q96RT8 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBGCP5Q96RT8 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBGCP5Q96RT8 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBGCP5Q96RT8 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBGCP5Q96RT8 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBGCP5Q96RT8 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBGCP5Q96RT8 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBGCP5Q96RT8 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBGCP5Q96RT8 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBGCP5Q96RT8 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBGCP5Q96RT8 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBGCP5Q96RT8 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBGCP5Q96RT8 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBGCP5Q96RT8 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBGCP5Q96RT8 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBGCP5Q96RT8 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TUBGCP5Q96RT8 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBGCP5Q96RT8 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBGCP5Q96RT8 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBGCP5Q96RT8 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBGCP5Q96RT8 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBGCP5Q96RT8 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBGCP5Q96RT8 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBGCP5Q96RT8 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBGCP5Q96RT8 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBGCP5Q96RT8 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBGCP5Q96RT8 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBGCP5Q96RT8 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBGCP5Q96RT8 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBGCP5Q96RT8 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBGCP5Q96RT8 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBGCP5Q96RT8 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBGCP5Q96RT8 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBGCP5Q96RT8 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBGCP5Q96RT8 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBGCP5Q96RT8 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBGCP5Q96RT8 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBGCP5Q96RT8 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBGCP5Q96RT8 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBGCP5Q96RT8 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBGCP5Q96RT8 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBGCP5Q96RT8 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBGCP5Q96RT8 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBGCP5Q96RT8 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TUBGCP5Q96RT8 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 155 ms