Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ2

CLMN, Calmin, humanhuman

Predictions only

Length 1,002 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMNQ96JQ2 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLMNQ96JQ2 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLMNQ96JQ2 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLMNQ96JQ2 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLMNQ96JQ2 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLMNQ96JQ2 AC234644.1-201ENST00000406065 370 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CLMNQ96JQ2 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLMNQ96JQ2 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLMNQ96JQ2 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLMNQ96JQ2 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLMNQ96JQ2 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CLMNQ96JQ2 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLMNQ96JQ2 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CLMNQ96JQ2 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLMNQ96JQ2 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLMNQ96JQ2 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLMNQ96JQ2 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLMNQ96JQ2 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLMNQ96JQ2 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLMNQ96JQ2 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLMNQ96JQ2 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLMNQ96JQ2 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLMNQ96JQ2 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLMNQ96JQ2 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLMNQ96JQ2 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CLMNQ96JQ2 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLMNQ96JQ2 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLMNQ96JQ2 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLMNQ96JQ2 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLMNQ96JQ2 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLMNQ96JQ2 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLMNQ96JQ2 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLMNQ96JQ2 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLMNQ96JQ2 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLMNQ96JQ2 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLMNQ96JQ2 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLMNQ96JQ2 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLMNQ96JQ2 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLMNQ96JQ2 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLMNQ96JQ2 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLMNQ96JQ2 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLMNQ96JQ2 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLMNQ96JQ2 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLMNQ96JQ2 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLMNQ96JQ2 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLMNQ96JQ2 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLMNQ96JQ2 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLMNQ96JQ2 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLMNQ96JQ2 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLMNQ96JQ2 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLMNQ96JQ2 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLMNQ96JQ2 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLMNQ96JQ2 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLMNQ96JQ2 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLMNQ96JQ2 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLMNQ96JQ2 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CLMNQ96JQ2 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLMNQ96JQ2 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLMNQ96JQ2 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CLMNQ96JQ2 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLMNQ96JQ2 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLMNQ96JQ2 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CLMNQ96JQ2 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLMNQ96JQ2 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLMNQ96JQ2 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLMNQ96JQ2 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLMNQ96JQ2 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLMNQ96JQ2 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLMNQ96JQ2 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLMNQ96JQ2 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLMNQ96JQ2 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLMNQ96JQ2 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLMNQ96JQ2 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLMNQ96JQ2 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLMNQ96JQ2 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLMNQ96JQ2 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLMNQ96JQ2 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLMNQ96JQ2 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLMNQ96JQ2 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLMNQ96JQ2 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLMNQ96JQ2 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLMNQ96JQ2 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLMNQ96JQ2 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLMNQ96JQ2 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLMNQ96JQ2 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLMNQ96JQ2 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLMNQ96JQ2 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLMNQ96JQ2 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLMNQ96JQ2 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLMNQ96JQ2 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLMNQ96JQ2 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLMNQ96JQ2 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CLMNQ96JQ2 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLMNQ96JQ2 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLMNQ96JQ2 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLMNQ96JQ2 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CLMNQ96JQ2 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CLMNQ96JQ2 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLMNQ96JQ2 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLMNQ96JQ2 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.5 ms