Protein–RNA interactions for Protein: Q96GS4

BORCS6, BLOC-1-related complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS6Q96GS4 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BORCS6Q96GS4 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BORCS6Q96GS4 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BORCS6Q96GS4 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BORCS6Q96GS4 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BORCS6Q96GS4 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BORCS6Q96GS4 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BORCS6Q96GS4 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BORCS6Q96GS4 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BORCS6Q96GS4 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BORCS6Q96GS4 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BORCS6Q96GS4 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
BORCS6Q96GS4 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BORCS6Q96GS4 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BORCS6Q96GS4 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BORCS6Q96GS4 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
BORCS6Q96GS4 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BORCS6Q96GS4 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BORCS6Q96GS4 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BORCS6Q96GS4 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BORCS6Q96GS4 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BORCS6Q96GS4 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
BORCS6Q96GS4 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
BORCS6Q96GS4 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BORCS6Q96GS4 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BORCS6Q96GS4 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BORCS6Q96GS4 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BORCS6Q96GS4 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BORCS6Q96GS4 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BORCS6Q96GS4 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BORCS6Q96GS4 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BORCS6Q96GS4 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BORCS6Q96GS4 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BORCS6Q96GS4 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BORCS6Q96GS4 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BORCS6Q96GS4 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BORCS6Q96GS4 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BORCS6Q96GS4 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BORCS6Q96GS4 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BORCS6Q96GS4 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BORCS6Q96GS4 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BORCS6Q96GS4 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BORCS6Q96GS4 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BORCS6Q96GS4 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BORCS6Q96GS4 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BORCS6Q96GS4 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BORCS6Q96GS4 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BORCS6Q96GS4 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BORCS6Q96GS4 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BORCS6Q96GS4 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BORCS6Q96GS4 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BORCS6Q96GS4 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BORCS6Q96GS4 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BORCS6Q96GS4 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BORCS6Q96GS4 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BORCS6Q96GS4 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BORCS6Q96GS4 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BORCS6Q96GS4 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BORCS6Q96GS4 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BORCS6Q96GS4 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
BORCS6Q96GS4 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BORCS6Q96GS4 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BORCS6Q96GS4 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BORCS6Q96GS4 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BORCS6Q96GS4 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BORCS6Q96GS4 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
BORCS6Q96GS4 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BORCS6Q96GS4 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BORCS6Q96GS4 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BORCS6Q96GS4 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BORCS6Q96GS4 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
BORCS6Q96GS4 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BORCS6Q96GS4 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BORCS6Q96GS4 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BORCS6Q96GS4 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BORCS6Q96GS4 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BORCS6Q96GS4 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
BORCS6Q96GS4 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BORCS6Q96GS4 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BORCS6Q96GS4 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BORCS6Q96GS4 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BORCS6Q96GS4 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BORCS6Q96GS4 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BORCS6Q96GS4 LINC00926-202ENST00000502027 2141 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BORCS6Q96GS4 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BORCS6Q96GS4 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BORCS6Q96GS4 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BORCS6Q96GS4 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BORCS6Q96GS4 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BORCS6Q96GS4 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BORCS6Q96GS4 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BORCS6Q96GS4 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BORCS6Q96GS4 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BORCS6Q96GS4 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BORCS6Q96GS4 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BORCS6Q96GS4 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BORCS6Q96GS4 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BORCS6Q96GS4 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BORCS6Q96GS4 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BORCS6Q96GS4 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms