Protein–RNA interactions for Protein: Q969W0

SPTSSA, Serine palmitoyltransferase small subunit A, humanhuman

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Length 71 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSAQ969W0 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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SPTSSAQ969W0 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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SPTSSAQ969W0 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
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SPTSSAQ969W0 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SPTSSAQ969W0 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
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