Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXD2

SCG3, Secretogranin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG3Q8WXD2 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCG3Q8WXD2 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.5 ms