Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC6

COPS9, COP9 signalosome complex subunit 9, humanhuman

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Length 57 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS9Q8WXC6 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 SORL1-201ENST00000260197 10904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 ERCC6L2-201ENST00000288985 4564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 NBN-203ENST00000409330 4523 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 NRP1-208ENST00000395995 5826 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 ZNF773-205ENST00000599847 5832 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 ADCY1-201ENST00000297323 12503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 PER3-202ENST00000377532 6279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 CREBBP-202ENST00000382070 7598 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC10.22□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC10.22□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 TRAPPC9-201ENST00000389328 4474 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 TIAF1-201ENST00000359450 5337 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 ZNF831-203ENST00000637017 10953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 NSD2-205ENST00000382892 7706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 EGR2-202ENST00000411732 2824 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 SYNPO-202ENST00000394243 7063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
COPS9Q8WXC6 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
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