Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUT4

LRRN4, Leucine-rich repeat neuronal protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 740 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRN4Q8WUT4 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRN4Q8WUT4 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRN4Q8WUT4 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRN4Q8WUT4 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRN4Q8WUT4 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRN4Q8WUT4 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRN4Q8WUT4 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRN4Q8WUT4 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRN4Q8WUT4 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRN4Q8WUT4 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRN4Q8WUT4 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRN4Q8WUT4 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRN4Q8WUT4 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRN4Q8WUT4 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRN4Q8WUT4 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRN4Q8WUT4 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRN4Q8WUT4 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRN4Q8WUT4 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRN4Q8WUT4 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRN4Q8WUT4 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRN4Q8WUT4 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRN4Q8WUT4 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRN4Q8WUT4 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRN4Q8WUT4 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRN4Q8WUT4 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRN4Q8WUT4 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRN4Q8WUT4 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRN4Q8WUT4 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRN4Q8WUT4 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRN4Q8WUT4 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRN4Q8WUT4 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRN4Q8WUT4 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRN4Q8WUT4 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRN4Q8WUT4 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRN4Q8WUT4 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRN4Q8WUT4 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRN4Q8WUT4 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRN4Q8WUT4 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRN4Q8WUT4 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRN4Q8WUT4 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRN4Q8WUT4 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRN4Q8WUT4 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRN4Q8WUT4 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRN4Q8WUT4 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRN4Q8WUT4 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRN4Q8WUT4 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRN4Q8WUT4 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRN4Q8WUT4 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRN4Q8WUT4 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRN4Q8WUT4 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRN4Q8WUT4 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRN4Q8WUT4 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRN4Q8WUT4 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRN4Q8WUT4 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRN4Q8WUT4 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRN4Q8WUT4 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRN4Q8WUT4 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRN4Q8WUT4 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRN4Q8WUT4 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRN4Q8WUT4 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRN4Q8WUT4 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRN4Q8WUT4 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRN4Q8WUT4 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRN4Q8WUT4 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRN4Q8WUT4 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRN4Q8WUT4 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRN4Q8WUT4 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRN4Q8WUT4 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRN4Q8WUT4 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRN4Q8WUT4 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRN4Q8WUT4 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRN4Q8WUT4 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRN4Q8WUT4 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRN4Q8WUT4 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRN4Q8WUT4 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRN4Q8WUT4 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRN4Q8WUT4 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRN4Q8WUT4 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRN4Q8WUT4 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRN4Q8WUT4 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRN4Q8WUT4 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRN4Q8WUT4 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRN4Q8WUT4 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRN4Q8WUT4 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRN4Q8WUT4 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRN4Q8WUT4 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRN4Q8WUT4 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRN4Q8WUT4 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRN4Q8WUT4 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRN4Q8WUT4 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRN4Q8WUT4 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRN4Q8WUT4 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRN4Q8WUT4 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRN4Q8WUT4 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRN4Q8WUT4 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRN4Q8WUT4 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRN4Q8WUT4 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRN4Q8WUT4 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRN4Q8WUT4 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LRRN4Q8WUT4 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms