Protein–RNA interactions for Protein: Q8NB78

KDM1B, Lysine-specific histone demethylase 1B, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM1BQ8NB78 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KDM1BQ8NB78 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KDM1BQ8NB78 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KDM1BQ8NB78 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KDM1BQ8NB78 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KDM1BQ8NB78 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KDM1BQ8NB78 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KDM1BQ8NB78 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KDM1BQ8NB78 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KDM1BQ8NB78 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KDM1BQ8NB78 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KDM1BQ8NB78 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KDM1BQ8NB78 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KDM1BQ8NB78 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KDM1BQ8NB78 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KDM1BQ8NB78 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KDM1BQ8NB78 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KDM1BQ8NB78 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KDM1BQ8NB78 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KDM1BQ8NB78 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KDM1BQ8NB78 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KDM1BQ8NB78 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KDM1BQ8NB78 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KDM1BQ8NB78 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KDM1BQ8NB78 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KDM1BQ8NB78 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
KDM1BQ8NB78 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KDM1BQ8NB78 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KDM1BQ8NB78 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KDM1BQ8NB78 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KDM1BQ8NB78 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KDM1BQ8NB78 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KDM1BQ8NB78 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KDM1BQ8NB78 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KDM1BQ8NB78 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KDM1BQ8NB78 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KDM1BQ8NB78 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KDM1BQ8NB78 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KDM1BQ8NB78 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KDM1BQ8NB78 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
KDM1BQ8NB78 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
KDM1BQ8NB78 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KDM1BQ8NB78 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KDM1BQ8NB78 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KDM1BQ8NB78 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KDM1BQ8NB78 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KDM1BQ8NB78 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KDM1BQ8NB78 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KDM1BQ8NB78 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KDM1BQ8NB78 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KDM1BQ8NB78 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KDM1BQ8NB78 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KDM1BQ8NB78 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KDM1BQ8NB78 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KDM1BQ8NB78 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KDM1BQ8NB78 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KDM1BQ8NB78 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KDM1BQ8NB78 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KDM1BQ8NB78 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KDM1BQ8NB78 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KDM1BQ8NB78 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KDM1BQ8NB78 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KDM1BQ8NB78 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KDM1BQ8NB78 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KDM1BQ8NB78 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KDM1BQ8NB78 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KDM1BQ8NB78 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KDM1BQ8NB78 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KDM1BQ8NB78 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KDM1BQ8NB78 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KDM1BQ8NB78 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KDM1BQ8NB78 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KDM1BQ8NB78 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KDM1BQ8NB78 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KDM1BQ8NB78 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KDM1BQ8NB78 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KDM1BQ8NB78 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KDM1BQ8NB78 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KDM1BQ8NB78 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KDM1BQ8NB78 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KDM1BQ8NB78 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KDM1BQ8NB78 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KDM1BQ8NB78 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KDM1BQ8NB78 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KDM1BQ8NB78 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KDM1BQ8NB78 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KDM1BQ8NB78 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KDM1BQ8NB78 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KDM1BQ8NB78 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KDM1BQ8NB78 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KDM1BQ8NB78 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KDM1BQ8NB78 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KDM1BQ8NB78 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KDM1BQ8NB78 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KDM1BQ8NB78 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KDM1BQ8NB78 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KDM1BQ8NB78 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KDM1BQ8NB78 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KDM1BQ8NB78 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KDM1BQ8NB78 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.4 ms