Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC84Q86UT8 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms