Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7E8

UBE2Q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2Q1Q7Z7E8 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBE2Q1Q7Z7E8 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBE2Q1Q7Z7E8 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBE2Q1Q7Z7E8 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBE2Q1Q7Z7E8 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBE2Q1Q7Z7E8 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBE2Q1Q7Z7E8 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBE2Q1Q7Z7E8 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBE2Q1Q7Z7E8 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBE2Q1Q7Z7E8 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBE2Q1Q7Z7E8 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBE2Q1Q7Z7E8 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE2Q1Q7Z7E8 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE2Q1Q7Z7E8 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE2Q1Q7Z7E8 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE2Q1Q7Z7E8 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE2Q1Q7Z7E8 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE2Q1Q7Z7E8 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE2Q1Q7Z7E8 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE2Q1Q7Z7E8 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE2Q1Q7Z7E8 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE2Q1Q7Z7E8 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE2Q1Q7Z7E8 MBD3L3-201ENST00000333843 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE2Q1Q7Z7E8 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE2Q1Q7Z7E8 TRAPPC3-201ENST00000373159 590 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE2Q1Q7Z7E8 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE2Q1Q7Z7E8 AC012506.1-201ENST00000423706 525 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE2Q1Q7Z7E8 GNG10P1-201ENST00000452289 199 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE2Q1Q7Z7E8 RN7SL582P-201ENST00000491078 279 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE2Q1Q7Z7E8 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE2Q1Q7Z7E8 TREHP1-201ENST00000531328 465 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE2Q1Q7Z7E8 DUXAP9-201ENST00000547220 665 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE2Q1Q7Z7E8 USB1-205ENST00000561743 1135 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE2Q1Q7Z7E8 AC018846.1-201ENST00000568231 183 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE2Q1Q7Z7E8 AC023090.1-201ENST00000592906 502 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE2Q1Q7Z7E8 MCEMP1-202ENST00000597445 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE2Q1Q7Z7E8 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE2Q1Q7Z7E8 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE2Q1Q7Z7E8 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE2Q1Q7Z7E8 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE2Q1Q7Z7E8 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE2Q1Q7Z7E8 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE2Q1Q7Z7E8 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE2Q1Q7Z7E8 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE2Q1Q7Z7E8 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE2Q1Q7Z7E8 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE2Q1Q7Z7E8 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE2Q1Q7Z7E8 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE2Q1Q7Z7E8 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE2Q1Q7Z7E8 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
UBE2Q1Q7Z7E8 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2Q1Q7Z7E8 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2Q1Q7Z7E8 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2Q1Q7Z7E8 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2Q1Q7Z7E8 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2Q1Q7Z7E8 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2Q1Q7Z7E8 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2Q1Q7Z7E8 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2Q1Q7Z7E8 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2Q1Q7Z7E8 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2Q1Q7Z7E8 LAMA1-209ENST00000638611 1310 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2Q1Q7Z7E8 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2Q1Q7Z7E8 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2Q1Q7Z7E8 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2Q1Q7Z7E8 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2Q1Q7Z7E8 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2Q1Q7Z7E8 CRYGC-201ENST00000282141 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2Q1Q7Z7E8 COX8A-201ENST00000314133 507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2Q1Q7Z7E8 SNX15-201ENST00000352068 771 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2Q1Q7Z7E8 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2Q1Q7Z7E8 CYB561D1-203ENST00000393709 620 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2Q1Q7Z7E8 PPM1N-205ENST00000401705 771 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2Q1Q7Z7E8 MIR1301-201ENST00000408518 82 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2Q1Q7Z7E8 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2Q1Q7Z7E8 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2Q1Q7Z7E8 AL121845.1-201ENST00000447343 464 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2Q1Q7Z7E8 AC018638.5-201ENST00000450885 754 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2Q1Q7Z7E8 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2Q1Q7Z7E8 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2Q1Q7Z7E8 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2Q1Q7Z7E8 AC130456.3-201ENST00000561762 633 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2Q1Q7Z7E8 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2Q1Q7Z7E8 SNX11-210ENST00000582104 1282 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2Q1Q7Z7E8 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2Q1Q7Z7E8 CTSV-201ENST00000259470 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2Q1Q7Z7E8 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2Q1Q7Z7E8 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2Q1Q7Z7E8 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2Q1Q7Z7E8 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2Q1Q7Z7E8 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2Q1Q7Z7E8 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2Q1Q7Z7E8 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2Q1Q7Z7E8 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2Q1Q7Z7E8 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2Q1Q7Z7E8 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2Q1Q7Z7E8 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2Q1Q7Z7E8 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBE2Q1Q7Z7E8 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBE2Q1Q7Z7E8 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBE2Q1Q7Z7E8 COQ3-201ENST00000254759 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms