Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BHLHA9Q7RTU4 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 148.1 ms