Protein–RNA interactions for Protein: Q6GV28

TMEM225, Transmembrane protein 225, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225Q6GV28 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
TMEM225Q6GV28 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TMEM225Q6GV28 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TMEM225Q6GV28 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TMEM225Q6GV28 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TMEM225Q6GV28 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TMEM225Q6GV28 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TMEM225Q6GV28 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TMEM225Q6GV28 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TMEM225Q6GV28 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TMEM225Q6GV28 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TMEM225Q6GV28 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TMEM225Q6GV28 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TMEM225Q6GV28 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TMEM225Q6GV28 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
TMEM225Q6GV28 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TMEM225Q6GV28 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TMEM225Q6GV28 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TMEM225Q6GV28 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TMEM225Q6GV28 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TMEM225Q6GV28 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TMEM225Q6GV28 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
TMEM225Q6GV28 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
TMEM225Q6GV28 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
TMEM225Q6GV28 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TMEM225Q6GV28 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TMEM225Q6GV28 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TMEM225Q6GV28 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TMEM225Q6GV28 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TMEM225Q6GV28 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TMEM225Q6GV28 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TMEM225Q6GV28 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TMEM225Q6GV28 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TMEM225Q6GV28 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TMEM225Q6GV28 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TMEM225Q6GV28 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TMEM225Q6GV28 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TMEM225Q6GV28 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TMEM225Q6GV28 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TMEM225Q6GV28 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TMEM225Q6GV28 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TMEM225Q6GV28 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TMEM225Q6GV28 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TMEM225Q6GV28 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TMEM225Q6GV28 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TMEM225Q6GV28 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TMEM225Q6GV28 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TMEM225Q6GV28 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
TMEM225Q6GV28 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TMEM225Q6GV28 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TMEM225Q6GV28 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TMEM225Q6GV28 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TMEM225Q6GV28 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TMEM225Q6GV28 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TMEM225Q6GV28 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TMEM225Q6GV28 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TMEM225Q6GV28 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TMEM225Q6GV28 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
TMEM225Q6GV28 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TMEM225Q6GV28 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TMEM225Q6GV28 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TMEM225Q6GV28 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TMEM225Q6GV28 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TMEM225Q6GV28 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TMEM225Q6GV28 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TMEM225Q6GV28 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TMEM225Q6GV28 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TMEM225Q6GV28 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TMEM225Q6GV28 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TMEM225Q6GV28 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TMEM225Q6GV28 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
TMEM225Q6GV28 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TMEM225Q6GV28 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TMEM225Q6GV28 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TMEM225Q6GV28 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
TMEM225Q6GV28 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
TMEM225Q6GV28 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TMEM225Q6GV28 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TMEM225Q6GV28 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TMEM225Q6GV28 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
TMEM225Q6GV28 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TMEM225Q6GV28 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TMEM225Q6GV28 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TMEM225Q6GV28 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TMEM225Q6GV28 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TMEM225Q6GV28 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TMEM225Q6GV28 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TMEM225Q6GV28 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
TMEM225Q6GV28 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TMEM225Q6GV28 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TMEM225Q6GV28 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
TMEM225Q6GV28 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TMEM225Q6GV28 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TMEM225Q6GV28 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TMEM225Q6GV28 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
TMEM225Q6GV28 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
TMEM225Q6GV28 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TMEM225Q6GV28 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TMEM225Q6GV28 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
TMEM225Q6GV28 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms