Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 OR2J1-201ENST00000377171 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 LINC01837-201ENST00000590021 1320 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 CAMTA1-205ENST00000467404 546 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 AC005899.5-201ENST00000584721 552 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM259Q4ZIN3 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.3 ms