Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZHG4

FNDC1, Fibronectin type III domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC1Q4ZHG4 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FNDC1Q4ZHG4 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FNDC1Q4ZHG4 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FNDC1Q4ZHG4 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FNDC1Q4ZHG4 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FNDC1Q4ZHG4 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FNDC1Q4ZHG4 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FNDC1Q4ZHG4 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FNDC1Q4ZHG4 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FNDC1Q4ZHG4 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FNDC1Q4ZHG4 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FNDC1Q4ZHG4 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FNDC1Q4ZHG4 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FNDC1Q4ZHG4 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FNDC1Q4ZHG4 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FNDC1Q4ZHG4 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FNDC1Q4ZHG4 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FNDC1Q4ZHG4 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FNDC1Q4ZHG4 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FNDC1Q4ZHG4 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FNDC1Q4ZHG4 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FNDC1Q4ZHG4 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
FNDC1Q4ZHG4 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FNDC1Q4ZHG4 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
FNDC1Q4ZHG4 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FNDC1Q4ZHG4 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FNDC1Q4ZHG4 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FNDC1Q4ZHG4 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FNDC1Q4ZHG4 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
FNDC1Q4ZHG4 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FNDC1Q4ZHG4 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FNDC1Q4ZHG4 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FNDC1Q4ZHG4 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FNDC1Q4ZHG4 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FNDC1Q4ZHG4 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FNDC1Q4ZHG4 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FNDC1Q4ZHG4 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FNDC1Q4ZHG4 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FNDC1Q4ZHG4 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FNDC1Q4ZHG4 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FNDC1Q4ZHG4 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
FNDC1Q4ZHG4 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FNDC1Q4ZHG4 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FNDC1Q4ZHG4 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
FNDC1Q4ZHG4 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FNDC1Q4ZHG4 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FNDC1Q4ZHG4 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FNDC1Q4ZHG4 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FNDC1Q4ZHG4 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
FNDC1Q4ZHG4 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FNDC1Q4ZHG4 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FNDC1Q4ZHG4 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FNDC1Q4ZHG4 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FNDC1Q4ZHG4 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FNDC1Q4ZHG4 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FNDC1Q4ZHG4 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FNDC1Q4ZHG4 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
FNDC1Q4ZHG4 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FNDC1Q4ZHG4 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FNDC1Q4ZHG4 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FNDC1Q4ZHG4 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNDC1Q4ZHG4 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNDC1Q4ZHG4 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNDC1Q4ZHG4 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNDC1Q4ZHG4 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNDC1Q4ZHG4 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNDC1Q4ZHG4 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNDC1Q4ZHG4 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNDC1Q4ZHG4 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNDC1Q4ZHG4 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNDC1Q4ZHG4 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNDC1Q4ZHG4 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNDC1Q4ZHG4 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNDC1Q4ZHG4 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNDC1Q4ZHG4 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNDC1Q4ZHG4 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNDC1Q4ZHG4 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNDC1Q4ZHG4 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNDC1Q4ZHG4 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNDC1Q4ZHG4 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
FNDC1Q4ZHG4 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
FNDC1Q4ZHG4 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNDC1Q4ZHG4 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNDC1Q4ZHG4 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNDC1Q4ZHG4 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNDC1Q4ZHG4 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNDC1Q4ZHG4 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNDC1Q4ZHG4 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNDC1Q4ZHG4 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNDC1Q4ZHG4 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNDC1Q4ZHG4 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNDC1Q4ZHG4 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNDC1Q4ZHG4 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNDC1Q4ZHG4 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNDC1Q4ZHG4 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNDC1Q4ZHG4 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNDC1Q4ZHG4 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNDC1Q4ZHG4 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNDC1Q4ZHG4 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNDC1Q4ZHG4 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms