Protein–RNA interactions for Protein: Q30KQ8

DEFB112, Beta-defensin 112, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFB112Q30KQ8 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
DEFB112Q30KQ8 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
DEFB112Q30KQ8 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
DEFB112Q30KQ8 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
DEFB112Q30KQ8 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
DEFB112Q30KQ8 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
DEFB112Q30KQ8 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
DEFB112Q30KQ8 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
DEFB112Q30KQ8 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
DEFB112Q30KQ8 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
DEFB112Q30KQ8 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
DEFB112Q30KQ8 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
DEFB112Q30KQ8 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
DEFB112Q30KQ8 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
DEFB112Q30KQ8 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
DEFB112Q30KQ8 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
DEFB112Q30KQ8 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
DEFB112Q30KQ8 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
DEFB112Q30KQ8 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
DEFB112Q30KQ8 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
DEFB112Q30KQ8 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
DEFB112Q30KQ8 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
DEFB112Q30KQ8 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
DEFB112Q30KQ8 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
DEFB112Q30KQ8 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
DEFB112Q30KQ8 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
DEFB112Q30KQ8 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
DEFB112Q30KQ8 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
DEFB112Q30KQ8 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
DEFB112Q30KQ8 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
DEFB112Q30KQ8 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
DEFB112Q30KQ8 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
DEFB112Q30KQ8 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
DEFB112Q30KQ8 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
DEFB112Q30KQ8 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.01□□□□□ -0.49
DEFB112Q30KQ8 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
DEFB112Q30KQ8 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
DEFB112Q30KQ8 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
DEFB112Q30KQ8 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
DEFB112Q30KQ8 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
DEFB112Q30KQ8 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
DEFB112Q30KQ8 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
DEFB112Q30KQ8 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
DEFB112Q30KQ8 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
DEFB112Q30KQ8 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
DEFB112Q30KQ8 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
DEFB112Q30KQ8 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
DEFB112Q30KQ8 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
DEFB112Q30KQ8 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
DEFB112Q30KQ8 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
DEFB112Q30KQ8 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
DEFB112Q30KQ8 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
DEFB112Q30KQ8 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
DEFB112Q30KQ8 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
DEFB112Q30KQ8 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
DEFB112Q30KQ8 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
DEFB112Q30KQ8 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
DEFB112Q30KQ8 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
DEFB112Q30KQ8 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
DEFB112Q30KQ8 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
DEFB112Q30KQ8 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
DEFB112Q30KQ8 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
DEFB112Q30KQ8 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
DEFB112Q30KQ8 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
DEFB112Q30KQ8 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
DEFB112Q30KQ8 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
DEFB112Q30KQ8 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
DEFB112Q30KQ8 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
DEFB112Q30KQ8 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
DEFB112Q30KQ8 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
DEFB112Q30KQ8 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
DEFB112Q30KQ8 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
DEFB112Q30KQ8 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
DEFB112Q30KQ8 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
DEFB112Q30KQ8 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
DEFB112Q30KQ8 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC12□□□□□ -0.49
DEFB112Q30KQ8 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
DEFB112Q30KQ8 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
DEFB112Q30KQ8 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
DEFB112Q30KQ8 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
DEFB112Q30KQ8 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
DEFB112Q30KQ8 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC12□□□□□ -0.49
DEFB112Q30KQ8 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC12□□□□□ -0.49
DEFB112Q30KQ8 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
DEFB112Q30KQ8 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC12□□□□□ -0.49
DEFB112Q30KQ8 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
DEFB112Q30KQ8 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
DEFB112Q30KQ8 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
DEFB112Q30KQ8 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC12□□□□□ -0.49
DEFB112Q30KQ8 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC12□□□□□ -0.49
DEFB112Q30KQ8 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC12□□□□□ -0.49
DEFB112Q30KQ8 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
DEFB112Q30KQ8 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC12□□□□□ -0.49
DEFB112Q30KQ8 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
DEFB112Q30KQ8 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC12□□□□□ -0.49
DEFB112Q30KQ8 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC12□□□□□ -0.49
DEFB112Q30KQ8 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC12□□□□□ -0.49
DEFB112Q30KQ8 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC12□□□□□ -0.49
DEFB112Q30KQ8 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
DEFB112Q30KQ8 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms