Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDO1Q16878 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 139.2 ms