Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 MRPS28-201ENST00000276585 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 FAU-201ENST00000279259 461 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 CASP2-203ENST00000392925 616 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 AC092570.1-201ENST00000414446 469 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 AL121796.1-201ENST00000505702 466 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 C19orf70-203ENST00000587589 577 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 KLKP1-202ENST00000597246 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 CCDC187-203ENST00000569961 3158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 EIF4E2-205ENST00000409394 604 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 AL355537.2-201ENST00000453367 375 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 AC092896.1-201ENST00000465850 380 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 MYL4-202ENST00000393450 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 CDK2-203ENST00000440311 1031 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 DIO3OS-211ENST00000557532 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 PCK2-208ENST00000559250 1804 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 SULT1A1-201ENST00000314752 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 RPF1-201ENST00000370654 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 AHCYP3-201ENST00000420053 1279 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 PRKCZ-AS1-202ENST00000444529 622 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 CXCL12-205ENST00000395794 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 AC108734.2-201ENST00000420887 1069 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 IGHV3-43-201ENST00000434710 434 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 AL451000.1-201ENST00000451300 1186 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 FAHD2CP-203ENST00000467292 965 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 ANAPC15-204ENST00000535234 848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 ZNF671-203ENST00000596939 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 LINC01082-201ENST00000601250 441 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 RFPL3-201ENST00000249007 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 NCF4-201ENST00000248899 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 AC010186.1-201ENST00000546259 532 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 AC073896.4-201ENST00000553176 403 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 PHF23-213ENST00000613632 850 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 Metazoa_SRP.75-201ENST00000614439 293 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 ADAMTS9-AS1-216ENST00000626280 882 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 KCTD6-205ENST00000490264 1759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
LAMA3Q16787 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 CST9-201ENST00000376971 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 WIPI1-201ENST00000262139 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 IGHV5-51-201ENST00000390626 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 AC009163.5-202ENST00000571737 466 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
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