Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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RPE65Q16518 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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RPE65Q16518 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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RPE65Q16518 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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RPE65Q16518 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RPE65Q16518 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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