Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 FRMD4A-208ENST00000493380 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 PRB3-202ENST00000538488 1283 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 GNAO1-205ENST00000563661 1351 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 ACTBP7-201ENST00000418351 1124 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 EHMT2-AS1-201ENST00000434689 373 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 AC084752.1-201ENST00000509766 622 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 AC091564.6-201ENST00000526633 487 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 FAM192A-218ENST00000567439 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 AC100778.2-201ENST00000580150 483 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 AC244250.3-201ENST00000620749 366 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 MME-218ENST00000625667 363 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 LINC02021-201ENST00000504808 1608 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 CDC45-202ENST00000404724 1693 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 PRKAR2A-AS1-203ENST00000431705 592 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 PSMD4P1-201ENST00000433951 1109 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 SUMF2-210ENST00000437307 947 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC85BQ15834 CD59-210ENST00000528700 652 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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