Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PUM3Q15397 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms