Protein–RNA interactions for Protein: Q14973

SLC10A1, Sodium/bile acid cotransporter, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A1Q14973 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SLC10A1Q14973 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SLC10A1Q14973 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SLC10A1Q14973 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SLC10A1Q14973 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SLC10A1Q14973 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SLC10A1Q14973 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
SLC10A1Q14973 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SLC10A1Q14973 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SLC10A1Q14973 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SLC10A1Q14973 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SLC10A1Q14973 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SLC10A1Q14973 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SLC10A1Q14973 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SLC10A1Q14973 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SLC10A1Q14973 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SLC10A1Q14973 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
SLC10A1Q14973 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SLC10A1Q14973 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SLC10A1Q14973 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SLC10A1Q14973 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SLC10A1Q14973 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
SLC10A1Q14973 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SLC10A1Q14973 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SLC10A1Q14973 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
SLC10A1Q14973 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
SLC10A1Q14973 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SLC10A1Q14973 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SLC10A1Q14973 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
SLC10A1Q14973 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SLC10A1Q14973 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SLC10A1Q14973 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SLC10A1Q14973 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SLC10A1Q14973 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SLC10A1Q14973 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SLC10A1Q14973 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SLC10A1Q14973 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SLC10A1Q14973 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SLC10A1Q14973 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SLC10A1Q14973 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SLC10A1Q14973 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SLC10A1Q14973 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SLC10A1Q14973 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SLC10A1Q14973 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SLC10A1Q14973 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SLC10A1Q14973 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SLC10A1Q14973 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SLC10A1Q14973 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SLC10A1Q14973 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SLC10A1Q14973 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SLC10A1Q14973 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SLC10A1Q14973 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SLC10A1Q14973 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SLC10A1Q14973 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SLC10A1Q14973 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SLC10A1Q14973 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SLC10A1Q14973 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SLC10A1Q14973 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SLC10A1Q14973 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SLC10A1Q14973 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SLC10A1Q14973 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SLC10A1Q14973 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SLC10A1Q14973 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SLC10A1Q14973 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SLC10A1Q14973 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SLC10A1Q14973 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SLC10A1Q14973 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SLC10A1Q14973 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SLC10A1Q14973 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SLC10A1Q14973 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SLC10A1Q14973 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SLC10A1Q14973 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SLC10A1Q14973 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SLC10A1Q14973 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SLC10A1Q14973 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SLC10A1Q14973 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SLC10A1Q14973 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SLC10A1Q14973 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SLC10A1Q14973 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SLC10A1Q14973 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SLC10A1Q14973 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SLC10A1Q14973 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SLC10A1Q14973 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SLC10A1Q14973 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SLC10A1Q14973 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SLC10A1Q14973 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SLC10A1Q14973 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SLC10A1Q14973 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SLC10A1Q14973 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SLC10A1Q14973 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SLC10A1Q14973 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SLC10A1Q14973 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SLC10A1Q14973 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SLC10A1Q14973 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SLC10A1Q14973 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SLC10A1Q14973 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SLC10A1Q14973 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SLC10A1Q14973 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SLC10A1Q14973 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SLC10A1Q14973 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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