Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COL4A6Q14031 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COL4A6Q14031 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COL4A6Q14031 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COL4A6Q14031 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COL4A6Q14031 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COL4A6Q14031 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COL4A6Q14031 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COL4A6Q14031 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
COL4A6Q14031 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
COL4A6Q14031 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COL4A6Q14031 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COL4A6Q14031 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COL4A6Q14031 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COL4A6Q14031 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COL4A6Q14031 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COL4A6Q14031 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COL4A6Q14031 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COL4A6Q14031 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COL4A6Q14031 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COL4A6Q14031 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
COL4A6Q14031 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COL4A6Q14031 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COL4A6Q14031 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COL4A6Q14031 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COL4A6Q14031 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COL4A6Q14031 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COL4A6Q14031 SFT2D2-202ENST00000367829 491 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COL4A6Q14031 CCDC167-201ENST00000373408 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COL4A6Q14031 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COL4A6Q14031 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COL4A6Q14031 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COL4A6Q14031 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
COL4A6Q14031 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COL4A6Q14031 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COL4A6Q14031 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
COL4A6Q14031 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COL4A6Q14031 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COL4A6Q14031 NAMA-206ENST00000605377 509 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COL4A6Q14031 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COL4A6Q14031 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COL4A6Q14031 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COL4A6Q14031 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COL4A6Q14031 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COL4A6Q14031 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COL4A6Q14031 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
COL4A6Q14031 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COL4A6Q14031 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COL4A6Q14031 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
COL4A6Q14031 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL4A6Q14031 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL4A6Q14031 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL4A6Q14031 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL4A6Q14031 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL4A6Q14031 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL4A6Q14031 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL4A6Q14031 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL4A6Q14031 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL4A6Q14031 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL4A6Q14031 INS-IGF2-202ENST00000397270 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL4A6Q14031 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
COL4A6Q14031 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL4A6Q14031 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL4A6Q14031 AL138731.1-201ENST00000452624 739 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL4A6Q14031 SH3BGR-209ENST00000458295 812 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL4A6Q14031 APOPT1-209ENST00000492189 513 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL4A6Q14031 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL4A6Q14031 ORAOV1-209ENST00000538554 1000 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL4A6Q14031 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
COL4A6Q14031 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL4A6Q14031 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL4A6Q14031 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL4A6Q14031 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL4A6Q14031 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL4A6Q14031 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL4A6Q14031 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL4A6Q14031 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL4A6Q14031 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL4A6Q14031 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL4A6Q14031 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL4A6Q14031 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL4A6Q14031 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL4A6Q14031 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL4A6Q14031 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL4A6Q14031 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL4A6Q14031 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL4A6Q14031 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL4A6Q14031 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL4A6Q14031 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL4A6Q14031 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL4A6Q14031 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
COL4A6Q14031 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL4A6Q14031 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL4A6Q14031 OR2V1-201ENST00000329365 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL4A6Q14031 CTNNBIP1-201ENST00000377256 451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL4A6Q14031 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL4A6Q14031 NSD1-211ENST00000511258 809 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL4A6Q14031 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL4A6Q14031 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
COL4A6Q14031 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms