Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 CRYBG1-201ENST00000369066 7553 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 PPFIA4-204ENST00000447715 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CBFBQ13951 TSPOAP1-201ENST00000268893 7483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.9 ms