Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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DDX39BQ13838 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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DDX39BQ13838 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
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DDX39BQ13838 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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DDX39BQ13838 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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DDX39BQ13838 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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DDX39BQ13838 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DDX39BQ13838 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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