Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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RUNX3Q13761 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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RUNX3Q13761 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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RUNX3Q13761 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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RUNX3Q13761 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RUNX3Q13761 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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