Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Length 913 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CUL4BQ13620 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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