Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
PEX6Q13608 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
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