Protein–RNA interactions for Protein: Q13308

PTK7, Inactive tyrosine-protein kinase 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTK7Q13308 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PTK7Q13308 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTK7Q13308 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTK7Q13308 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTK7Q13308 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTK7Q13308 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTK7Q13308 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTK7Q13308 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTK7Q13308 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PTK7Q13308 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTK7Q13308 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTK7Q13308 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PTK7Q13308 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTK7Q13308 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTK7Q13308 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTK7Q13308 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PTK7Q13308 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PTK7Q13308 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PTK7Q13308 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTK7Q13308 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTK7Q13308 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTK7Q13308 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTK7Q13308 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTK7Q13308 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTK7Q13308 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTK7Q13308 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTK7Q13308 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTK7Q13308 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTK7Q13308 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTK7Q13308 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTK7Q13308 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTK7Q13308 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTK7Q13308 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTK7Q13308 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTK7Q13308 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTK7Q13308 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTK7Q13308 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTK7Q13308 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PTK7Q13308 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTK7Q13308 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTK7Q13308 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTK7Q13308 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTK7Q13308 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PTK7Q13308 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTK7Q13308 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTK7Q13308 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PTK7Q13308 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTK7Q13308 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTK7Q13308 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTK7Q13308 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTK7Q13308 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTK7Q13308 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTK7Q13308 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTK7Q13308 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTK7Q13308 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTK7Q13308 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTK7Q13308 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTK7Q13308 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTK7Q13308 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PTK7Q13308 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PTK7Q13308 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTK7Q13308 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PTK7Q13308 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTK7Q13308 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PTK7Q13308 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTK7Q13308 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTK7Q13308 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTK7Q13308 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTK7Q13308 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PTK7Q13308 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTK7Q13308 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PTK7Q13308 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTK7Q13308 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PTK7Q13308 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PTK7Q13308 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTK7Q13308 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTK7Q13308 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTK7Q13308 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PTK7Q13308 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTK7Q13308 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTK7Q13308 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTK7Q13308 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms