Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NME3Q13232 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NME3Q13232 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
NME3Q13232 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NME3Q13232 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NME3Q13232 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NME3Q13232 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NME3Q13232 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NME3Q13232 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NME3Q13232 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NME3Q13232 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NME3Q13232 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NME3Q13232 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NME3Q13232 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
NME3Q13232 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NME3Q13232 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NME3Q13232 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NME3Q13232 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NME3Q13232 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NME3Q13232 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NME3Q13232 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NME3Q13232 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NME3Q13232 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NME3Q13232 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NME3Q13232 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NME3Q13232 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NME3Q13232 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NME3Q13232 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NME3Q13232 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NME3Q13232 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NME3Q13232 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NME3Q13232 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NME3Q13232 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NME3Q13232 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NME3Q13232 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NME3Q13232 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NME3Q13232 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NME3Q13232 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NME3Q13232 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NME3Q13232 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NME3Q13232 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NME3Q13232 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NME3Q13232 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NME3Q13232 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NME3Q13232 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NME3Q13232 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NME3Q13232 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NME3Q13232 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NME3Q13232 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NME3Q13232 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NME3Q13232 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NME3Q13232 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NME3Q13232 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NME3Q13232 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NME3Q13232 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NME3Q13232 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NME3Q13232 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NME3Q13232 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NME3Q13232 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NME3Q13232 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NME3Q13232 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NME3Q13232 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NME3Q13232 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NME3Q13232 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NME3Q13232 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NME3Q13232 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NME3Q13232 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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NME3Q13232 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NME3Q13232 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NME3Q13232 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NME3Q13232 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NME3Q13232 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NME3Q13232 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NME3Q13232 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
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NME3Q13232 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NME3Q13232 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NME3Q13232 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NME3Q13232 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NME3Q13232 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NME3Q13232 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NME3Q13232 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NME3Q13232 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NME3Q13232 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NME3Q13232 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NME3Q13232 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NME3Q13232 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NME3Q13232 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NME3Q13232 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NME3Q13232 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NME3Q13232 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NME3Q13232 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NME3Q13232 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NME3Q13232 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NME3Q13232 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NME3Q13232 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NME3Q13232 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NME3Q13232 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
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