Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GRIK2Q13002 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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