Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NFX1Q12986 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms