Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

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Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
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FOXF2Q12947 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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FOXF2Q12947 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
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FOXF2Q12947 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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FOXF2Q12947 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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FOXF2Q12947 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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FOXF2Q12947 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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FOXF2Q12947 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
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FOXF2Q12947 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
FOXF2Q12947 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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