Protein–RNA interactions for Protein: Q12908

SLC10A2, Ileal sodium/bile acid cotransporter, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A2Q12908 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC10A2Q12908 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms