Protein–RNA interactions for Protein: Q12774

ARHGEF5, Rho guanine nucleotide exchange factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF5Q12774 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ARHGEF5Q12774 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARHGEF5Q12774 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARHGEF5Q12774 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARHGEF5Q12774 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARHGEF5Q12774 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARHGEF5Q12774 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARHGEF5Q12774 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ARHGEF5Q12774 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ARHGEF5Q12774 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARHGEF5Q12774 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARHGEF5Q12774 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARHGEF5Q12774 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARHGEF5Q12774 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
ARHGEF5Q12774 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARHGEF5Q12774 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARHGEF5Q12774 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARHGEF5Q12774 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARHGEF5Q12774 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
ARHGEF5Q12774 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARHGEF5Q12774 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARHGEF5Q12774 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARHGEF5Q12774 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARHGEF5Q12774 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARHGEF5Q12774 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
ARHGEF5Q12774 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
ARHGEF5Q12774 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARHGEF5Q12774 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARHGEF5Q12774 PPP1R2P4-201ENST00000424051 595 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
ARHGEF5Q12774 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARHGEF5Q12774 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARHGEF5Q12774 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARHGEF5Q12774 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARHGEF5Q12774 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARHGEF5Q12774 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARHGEF5Q12774 FAM104A-204ENST00000580032 451 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARHGEF5Q12774 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARHGEF5Q12774 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARHGEF5Q12774 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARHGEF5Q12774 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARHGEF5Q12774 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARHGEF5Q12774 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARHGEF5Q12774 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARHGEF5Q12774 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
ARHGEF5Q12774 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ARHGEF5Q12774 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
ARHGEF5Q12774 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARHGEF5Q12774 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARHGEF5Q12774 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARHGEF5Q12774 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARHGEF5Q12774 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARHGEF5Q12774 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARHGEF5Q12774 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARHGEF5Q12774 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARHGEF5Q12774 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARHGEF5Q12774 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ARHGEF5Q12774 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARHGEF5Q12774 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARHGEF5Q12774 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARHGEF5Q12774 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARHGEF5Q12774 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARHGEF5Q12774 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARHGEF5Q12774 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARHGEF5Q12774 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARHGEF5Q12774 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARHGEF5Q12774 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARHGEF5Q12774 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARHGEF5Q12774 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARHGEF5Q12774 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ARHGEF5Q12774 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ARHGEF5Q12774 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ARHGEF5Q12774 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ARHGEF5Q12774 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ARHGEF5Q12774 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ARHGEF5Q12774 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ARHGEF5Q12774 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ARHGEF5Q12774 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ARHGEF5Q12774 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ARHGEF5Q12774 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ARHGEF5Q12774 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ARHGEF5Q12774 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ARHGEF5Q12774 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ARHGEF5Q12774 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ARHGEF5Q12774 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ARHGEF5Q12774 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ARHGEF5Q12774 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ARHGEF5Q12774 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ARHGEF5Q12774 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ARHGEF5Q12774 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ARHGEF5Q12774 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ARHGEF5Q12774 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ARHGEF5Q12774 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ARHGEF5Q12774 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ARHGEF5Q12774 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ARHGEF5Q12774 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ARHGEF5Q12774 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ARHGEF5Q12774 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ARHGEF5Q12774 AC010335.1-201ENST00000594590 599 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ARHGEF5Q12774 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ARHGEF5Q12774 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms