Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 SDC1-202ENST00000381150 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 MAN2C1-216ENST00000563622 2961 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 TMPRSS12-202ENST00000551456 3336 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 AL118506.1-201ENST00000601296 3082 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 SCML4-203ENST00000369022 2377 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 ABCG8-201ENST00000272286 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 FRMD8-201ENST00000317568 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 LHX6-210ENST00000559895 3587 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 AC011298.1-201ENST00000407635 3398 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 RIPOR3-202ENST00000327979 4377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
CCDC173Q0VFZ6 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 PDK2-203ENST00000503176 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 CD99L2-208ENST00000613030 3742 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 RUFY4-201ENST00000344321 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 UBE2D3-210ENST00000453744 3990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC173Q0VFZ6 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms