Protein–RNA interactions for Protein: Q0PNE2

ELP6, Elongator complex protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELP6Q0PNE2 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ELP6Q0PNE2 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ELP6Q0PNE2 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ELP6Q0PNE2 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ELP6Q0PNE2 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ELP6Q0PNE2 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ELP6Q0PNE2 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ELP6Q0PNE2 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ELP6Q0PNE2 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ELP6Q0PNE2 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ELP6Q0PNE2 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ELP6Q0PNE2 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ELP6Q0PNE2 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ELP6Q0PNE2 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ELP6Q0PNE2 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ELP6Q0PNE2 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ELP6Q0PNE2 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ELP6Q0PNE2 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ELP6Q0PNE2 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ELP6Q0PNE2 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ELP6Q0PNE2 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ELP6Q0PNE2 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ELP6Q0PNE2 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ELP6Q0PNE2 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ELP6Q0PNE2 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ELP6Q0PNE2 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ELP6Q0PNE2 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ELP6Q0PNE2 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ELP6Q0PNE2 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ELP6Q0PNE2 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ELP6Q0PNE2 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ELP6Q0PNE2 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ELP6Q0PNE2 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ELP6Q0PNE2 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ELP6Q0PNE2 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ELP6Q0PNE2 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ELP6Q0PNE2 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ELP6Q0PNE2 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ELP6Q0PNE2 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ELP6Q0PNE2 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ELP6Q0PNE2 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ELP6Q0PNE2 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ELP6Q0PNE2 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ELP6Q0PNE2 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ELP6Q0PNE2 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ELP6Q0PNE2 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ELP6Q0PNE2 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ELP6Q0PNE2 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ELP6Q0PNE2 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ELP6Q0PNE2 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ELP6Q0PNE2 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ELP6Q0PNE2 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ELP6Q0PNE2 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ELP6Q0PNE2 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ELP6Q0PNE2 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ELP6Q0PNE2 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ELP6Q0PNE2 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ELP6Q0PNE2 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ELP6Q0PNE2 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ELP6Q0PNE2 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ELP6Q0PNE2 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ELP6Q0PNE2 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ELP6Q0PNE2 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ELP6Q0PNE2 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ELP6Q0PNE2 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ELP6Q0PNE2 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ELP6Q0PNE2 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ELP6Q0PNE2 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELP6Q0PNE2 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELP6Q0PNE2 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELP6Q0PNE2 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELP6Q0PNE2 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELP6Q0PNE2 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELP6Q0PNE2 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELP6Q0PNE2 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELP6Q0PNE2 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELP6Q0PNE2 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELP6Q0PNE2 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELP6Q0PNE2 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELP6Q0PNE2 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELP6Q0PNE2 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELP6Q0PNE2 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELP6Q0PNE2 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELP6Q0PNE2 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ELP6Q0PNE2 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELP6Q0PNE2 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ELP6Q0PNE2 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELP6Q0PNE2 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELP6Q0PNE2 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELP6Q0PNE2 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELP6Q0PNE2 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELP6Q0PNE2 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELP6Q0PNE2 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ELP6Q0PNE2 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ELP6Q0PNE2 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELP6Q0PNE2 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELP6Q0PNE2 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELP6Q0PNE2 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELP6Q0PNE2 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELP6Q0PNE2 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.3 ms